# Analyse Morphologique

Analyse morphologique est un outil developpé par le laboratoire geomecanique du centre PACA d'INRAE. Son but est d'extraire des informations sur la morphologie de scan 3D issues de tests HET (Hydraulic Erosion Test).
## Fonctionnalités

### Analyse de l'objet
- Lecture de fichiers .obj et .xyz
- Redressement et normalisation de l'objet
- Discretisation de l'objet en couche de taille egale
- Calcul d'indices morphologiques
- Export des indices morphologiques dans un fichier
- Affichage de graphiques :
    - Maillage de l'objet
    - Coupe de l'objet sur les axes xz et yz
    - Evolution du rayon moyen en fonction de la hauteur
    - Evolution de la difference entre le rayon moyen de chaque couche et la moyenne des rayons moyen en fonction de la hauteur
    - Coupe d'une couche selectionnée
    - Evolution de la difference entre le rayon de chaque point et le rayon moyen de la couche en fonction de l'angle theta (de 0 a 2pi)

![images/1.png](images/1.png)
![images/2.png](images/2.png)
![images/3.png](images/3.png)



## Installation et utilisation

Attention, ce programe ne fonctionne qu'avec les version de python 3.10 et superieur.

Pour utiliser programme, il suffit de cloner le depot, ou de télécharger une des [releases disponibles](https://forgemia.inra.fr/scanner3d/analysemorphologique/-/releases) et d'installer les dépendances avec pip.

```bash
git clone https://forgemia.inra.fr/scanner3d/analysemorphologique.git
cd analysemorphologique
pip install -r requirements.txt
python main.py
```

### Environement virtuel

Si vous utilisez Anaconda, il est possible que vous aiyez des problemes avec la bibliotheque pyQt.

```
```

vous pouvez neamoins utiliser le programe en créant un environement virtuel avec les dépendances necessaires. Pour cela, il faut créer un environement virtuel, l'activer, puis installer les dépendances.

```bash 
pip install venv
python -m venv venv
# Pour les utilisateurs de windows
venv\Scripts\activate.bat
# Pour les utilisateurs de linux ou mac
source venv/bin/activate
pip install -r requirements.txt
python main.py
```

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